Osim EU fondova projekti se u RH mogu financirati i iz EU Programa. Članstvom u Europskoj uniji, Hrvatska punopravno sudjeluje u svim postojećim Programima Unije.
Za razliku od EU fondova, kojima u RH upravljaju nacionalna tijela (središnje – koordinacijsko tijelo i provedbena tijela) i radi se isključivo o projektima u RH, o projektima iz Programa uglavnom odlučuju provedbena tijela EU, a na natječaje se u pravilu mogu prijaviti projekti iz svih zemalja članica EU.
Programi Europske unije 2014-2020.
- Zdravlje za rast – Treći višegodišnji program EU u području zdravstva
- Program za konkurentnost poduzeća i malih i srednjih poduzeća COSME
- Program EU za zaštitu potrošača 2014.-2020.
- Kreativna Europa
- Europa za građane
- Program o pravima jednakosti
- LIFE program za zaštitu okoliša i klimatske akcije
- Customs 2020
- Program za zapošljavanje i socijalne inovacije
- Fiscalis 2020.
- Program za zapošljavanje i socijalne inovacije
- Program za pravosuđe 2014.-2020.
- Hercule III
- Mehanizam Unije za civilnu zaštitu